臺山市審計局內設6個職能股（室）：
（一）辦公室。
負責文電、會務、機要、檔案、信訪、紀檢、黨群等機關日常工作；承擔信息、保密、政務公開、財務、統計、保衛、信息化建設、離退休人員服務、工青婦、計生等工作；負責機關人事管理、機構編制、勞動工資、教育培訓、審計專業技術考評等工作；擬訂審計工作的規劃、計劃和年度審計項目計劃等工作。負責人：馬維國，電話：5672195
（二）經濟責任審計股。
組織開展經濟責任審計工作；承擔全市經濟責任審計工作的協調、管理和業務指導工作，指導和監督農村集體經濟審計工作；承擔市經濟責任審計工作部門聯席會議有關工作。負責人：朱雪云，電話：5677066
（三）行政事業審計股。
組織審計市本級財政預算執行情況和其他財政收支情況；組織審計各鎮（場）人民政府預算執行、決算和其他財政收支情況；組織審計市地方稅務系統稅收征管情況；組織審計市直黨政群機關和事業單位、社會團體的預算執行情況和決算；組織審計市直黨政群機關及各鎮（場）人民政府管理的專項資金；開展相關專項審計調查。負責人：馬榮富，電話：5661194
（四）企業審計股。
組織審計市屬資產經營公司、授權經營企業集團等國有以及國有控股企業的資產、負債、損益；組織審計市駐外非經營性機構的財務收支，依法通過適當方式組織審計市屬國有企業的境外資產、負債和損益；組織審計國際組織和外國政府貸款、援助項目的財務收支；組織審計市屬國有金融機構的資產、負債、損益；開展相關專項審計調查。負責人：譚仕斌，電話：5662179
（五）綜合審計股。
組織審計市直人力資源和社會保障、衛生等主管部門、各鎮（場）人民政府管理和其他單位受市人民政府及其部門委托管理的社會保障基金、社會捐贈資金等；組織審計市政府投資和以市政府投資為主的建設項目的預算執行情況和決算；組織績效審計、管理審計工作；承擔社會審計和內部審計的監督工作。負責審計項目復核和質量檢查，審理有關審計業務事項。承擔有關行政復議和行政應訴等工作。負責人：譚暢儒，電話：5671140
（六）法規審理股 。
擬訂審計業務制度；審理有關審計業務事項，審核審計報告、審計決定、移送處理書等文書；依法檢查審計決定執行情況，督促糾正和處理審計發現的問題；牽頭起草審計發現問題的糾正和處理結果報告，承擔審計結果的綜合開發利用工作；承擔內部審計的監督工作；承擔有關行政復議和行政訴訟等工作；監督審計執法行為。負責人：劉峻燕，電話：5673179